La Fundació per al Foment de la Investigació Sanitària i Biomèdica (Fisabio), adscrito a la Conselleria de Sanidad, analiza junto con el Instituto de Biomedicina de València (vinculado al Consejo Superior de Investigaciones Científicas) y el Hospital General de Alicante la transmisión y el movimiento de las diferentes variantes del coronavirus en España. El equipo de investigación del Servicio de Secuenciación de Fisabio lleva analizadas desde que comenzó la pandemia 6.500 muestras de pacientes diagnosticados de covid-19 procedentes de casi medio centenar de hospitales de referencia de toda la geografía nacional, según han informado este sábado fuentes de Sanidad. En total, la Comunidad Valenciana lleva analizado el 88% del todas las muestras que se estudian en todo el país para seguir la transmisión y el movimiento del virus a escala nacional, así como para conocer sus variantes.
La monitorización del virus, han indicado las mismas fuentes comienza con la toma del exudado nasofaríngeo del paciente, que sigue dos caminos. El más conocido es el diagnóstico de si la persona tiene o no la COVID 19, pero un porcentaje suficientemente representativo de esas muestras viaja también hasta los laboratorios de secuenciación masiva. Este viaje se enmarca en el proyecto SeqCOVID, liderado por el investigador Iñaki Comas, del IBV-CSIC, junto con el investigador Fernando González Candelas, responsable de la Unidad Mixta Infección y Salud Pública Fisabio-Universitat de Valencia.
“Vamos leyendo el genoma del virus en pequeños fragmentos y luego, gracias al manejo de herramientas bioinformáticas por parte de Giuseppe D’Auria, los juntamos como si fuera un puzle. A partir del genoma completo, reconstruimos el "árbol genealógico" del virus. Sabiendo el grado de parentesco de los virus de los diferentes pacientes, podemos conocer si tienen un origen común”, explica Paula Ruiz, SARS-CoV-2 project manager en el Servicio de Secuenciación de la fundación Fisabio, que dirige Llúcia Martínez Priego. Esta secuenciación genómica, combinada con información epidemiológica (los contactos de la persona infectada o por dónde se ha movido, por ejemplo), es capaz de proveer de información valiosa a las autoridades de Salud Pública para que puedan adoptar medidas de control de la transmisión del virus.
Se trata de información útil, por ejemplo, para saber si la transmisión del coronavirus es local o comunitaria, identificar eventos de superdispersión (aquellos donde la mayoría de gente no transmite el virus, pero unos pocos infectados son capaces de contagiar a un gran número de personas), rastrear la ruta que está siguiendo el virus, cómo está mutando o si las nuevas variantes pueden comprometer la eficacia de las vacunas.
