El Ministerio de Economía y Competitividad ha distinguido a Instituto Bernabeu la condición de Empresa Innovadora, que reconoce a las instituciones que han demostrado un carácter innovador en el desempeño de su actividad y una contrastada capacidad de innovación en sus estudios de I+ D.
Dicho reconocimiento se materializada en la inclusión en el listado de empresas innovadoras de la Secretaría de Estado de Investigación, Desarrollo e Innovación, y en la obtención del Sello de Pyme innovadora, que tiene una validez de 3 años renovables y que acredita tal condición.